依据宋史记载，妈祖姓林名默娘，是福建湄洲人，父亲名叫林愿，母亲则为王氏。在妈祖出生之前，林家已经有了一男五女，因为林家独子体弱多病，母亲王氏日夜焚香祈祷，祈求上天再赐一子，以求光耀林家门楣。
在妈祖诞生之时，刚好是傍晚时刻，突然间有一道红光光彩夺目，射入了王氏的房间，奇香传入房间，久久无法散去，王氏此时分娩，不料又生下一个女婴，林家众人大失所望，但是由于妈祖诞生之时有祥瑞征兆，大家心想此女必非等闲之女，所以林家之人也对妈祖就特别的疼爱，因为妈祖从出生到弥月期间都不曾哭啼，于是林家给她取名为林默娘，也就是当今民间所祀奉的妈祖娘娘。
妈祖在年幼之时就是很聪明颖悟，八岁便到私塾读书，不但能过目成诵，并且精通诗文的意义，十岁就经常焚香礼佛，朝夕诵经从未敢懈怠。妈祖还特别地孝顺父母、敬爱兄姐，乡里和睦，人人都赞赏。
妈祖十三岁那一年，有一位老道士名叫玄通，他一身褴褛，来到了林家化缘，妈祖并未嫌弃玄通的穿著破烂，诚心邀请玄通进入林家，并乐于捐施给玄通，从此之后老道士就经常到林家化缘，妈祖都能以诚恳接待，更加施舍财物给老道士。因此老道士深为感动，并传授《玄微秘法》给妈祖，并供她日后去救济世人。
十六岁时的某一天，妈祖与同伴结伴在庭院的古井旁边玩耍，忽然间井中出现了一个面目狰狞的神人，他手执铜符冉冉地升起，同伴们看见了那神人便大大的惊吓而一哄而散，而妈祖却十分镇定地跪下膜拜那神人，神人将手中的铜符交给了妈祖，随后飘入云中而离去，妈祖得到此铜符，更加地潜心精研，学得了一身法术，她灵通万变，经常热心助人，为乡里驱邪救危，深受人人的爱戴。
十六岁那一年的秋天，有一天父亲与兄长驾船出海还未返回，天气突然间大变飓风大起，狂涛怒撼。当时妈祖正在屋内织布，预感父兄驾舟在海上必然凶多吉少，随时都会有沈船的危险，顿时伏卧在织布机上双眼紧闭，一手拿梭，一手拉线，脚踏着机轴，神情像似在乘风破浪。
此时她的母亲王氏走进屋内，在旁边看见这种情况，狂叫妈祖，妈祖她却完全不理会，好像完全失了神，王氏情急就猛拉她手臂，妈祖醒来一声的惊叫，手中的梭掉在地面上翻倒了，妈祖伤心含泪的哭道：“阿爸已经救上无恙，但是阿兄已经沈于海里死了。”
原来当时妈祖伏卧在织布机上时已经是入定出了元神，双脚踏在机轴上宛如是站在船上，她一手拉着父亲船头的碇绳，另一手掌着其兄的船舵，突然间被她母亲所拉醒，手中持梭狠摔在地面上，她哥哥的船因此就翻沈了。
不久之后林愿从海上回来一路上哭哭啼啼的回来，王氏不见儿子归来，心里知道儿子已经遇难了，立刻悲伤昏厥。隔天巨浪未平静，妈祖奋勇驾船出海，终于在茫茫的大海之中找到其兄的尸体捞回安葬。这次救父寻兄的事迹，立刻传遍了乡里，众人无不尊称她为“神姑”。
十七岁时的春天，一艘商船经过湄洲的海域，忽然间遇到浓雾而触礁，船底有破洞，随时都有沈船的危险，船上的商人个个惊慌失措，高声呼喊救命，此时妈祖正在家中诵经礼佛，隐约听到海上传来十分凄惨的呼救声，便祭起铜符察看，发现一艘商船触礁快要沉没了，妈祖赶紧请渔民们出海搭救，可是海上风浪巨大而且浓雾茫茫，谁也不敢去冒险。
妈祖看见情况紧急，在海边拔了数欉小草往海中一抛，顷刻海面浮出无数根巨大的杉木，如箭似般向遇难商船飘去，一根根并列在海中把船驾住，缓缓的驶到了湄洲屿，商人感到十分的神奇，赶紧询问当地渔民，才知道是妈祖化草成木的神迹救了他们，于是特地登门拜谢妈祖的救命之恩。妈祖日后更以大慈大悲、救苦救难的精神，行善济世，远遐驰名有口皆碑。
宋太宗四年，妈祖已经二十八岁，那一天妈祖特别早起梳洗换装，涂胭脂抹粉，盛装打扮成像仙女一般美丽，妈祖走出了闺房，低头轻声细语向几位姐姐告别，妈祖说道。
“今日乃是重阳佳节，我将要登高远游而去，希望诸位姐姐能够孝敬双亲，共享天伦之乐。”
妈祖依依不舍地拜别了双亲离去湄洲屿，此时是九九重阳节秋高气爽，湄洲山上金菊花盛开，海风轻拂潮音盈耳，妈祖一步步的登上了湄洲峰，站在一处山崖巨石之上，举目观澜，碧海连天，风平浪静，渔帆点点。
回顾湾内，水中有山，山外有海，山海奇观，晶莹夺目，景致优美，令人陶醉。此时从天空飘来一朵巨大的彩云，传来阵阵轻妙鼓乐笛曲声，顷刻湄洲峰香雾缭绕，妈祖走上了彩云之上，彩云冉冉升空，岛上的渔民百姓看见万里晴空有片艳丽缤纷彩云腾空而上，又隐约听见悦耳的丝管仙乐之声，云中有许多金童玉女，手握旌旗，顶着彩伞，若隐若现地簇拥着妈祖升天了。