光绪元年，刘坤一於江阴鹅鼻嘴炮台外，复於下游增筑炮台。其北岸之十圩港，亦增筑炮台，与南岸相犄角。又修改焦山、圌山关、乌龙山等处炮门，以期合法。五年，以外海兵轮统领驻吴淞口，凡沿海各省兵轮，悉归调遣。七年，令彭玉麟筹办江阴至吴淞口一带海防。重修圌山关、东生洲两岸旧筑炮堤，并筑营垒，置大炮。又改天都庙旧式炮台为明炮台。八年，左宗棠举办沿海渔团，选渔户精壮者五千人隶吴淞镇，给以粮械，随时操练。彭玉麟以狼、福山为长江总口，长江下游虽修治炮台，而江面空虚，铁甲大战舰无多，止有海防，未能海战。议造铁甲小兵舰十艘，专顾内洋，与炮台相掩护。十年，令安徽疆臣筹备上游江防。乃於安庆城外，筑明暗炮台各一座，石营一座。拦江矶北岸，建明炮台二座，石营一座，南岸建明炮台、石营各一座。西梁山建明炮台四座，石营一座，土营二座。东梁山就其形势，筑石城、炮堤各一道，以控制江面。十年，曾国荃以新购西洋十四口径八百磅子大炮及开花子弹，分置江阴、吴淞二口炮台。又购马梯尼快枪二千枝，分给各营。又於吴淞炮台增兵八营，江阴炮台增兵十二营，扼守江海总路。十三年，又增建吴淞、江阴炮台，以铁木石土各料筑成，各设新式后膛大炮，其旁佐以哈乞开司炮。江阴之四门大炮台，分建於小角山、黄山二处。黄山旧炮台所存之八十磅子后膛炮，移设於大石湾明炮台。凡炮台之门，各建炮房，护以三合土墙。又田鸡炮为军中利器，於江干要隘，建炮房，置田鸡炮，以资操练。二十二年，张之洞以江南各炮台分为四路，南路狮子林、南石塘各台为一路，南北岸各台为一路，象山、焦山、圌山关、天都庙各台为一路，江宁之狮子山、幕府山、锺山、下关各台为一路，设总管炮台官四员，以新购外洋四十馀磅子快枪炮三十具分置各炮台。二十五年，以长江水师兵力单弱，皖省防军尤少，令沿江督抚，不分畛域，节节设防。
三十一年，以东南各省新军，次第练成，命兵部侍郎铁良至江南考察江海防务。旋铁良覆陈江南之沿江海炮台，分为四路，曰吴淞，曰江阴，曰镇江，曰金陵。第一路吴淞炮台，在宝山县南，分设三台，置前后膛大小炮三十四具，炮勇三百馀人，水旱雷营二哨，雷勇一百馀人，以盛字五营驻防。第二路江阴炮台，在县城北，於长江南北岸分设炮台，南岸置前后膛大小炮三十七具，北岸置炮二十具，炮勇共四百馀人，水旱雷营三哨，雷勇二百馀人，以合字、南字等八营分两岸驻守。第三路镇江炮台五处，曰圌山关，曰东生洲，曰象山，曰焦山，曰天都庙。南岸各台置炮十五具，北岸各台置炮六具，炮勇二百馀人，以新湘二旗驻防。溯江至镇江府城，南岸象山，北岸天都庙，中流焦山，分设三台，象山置炮十八具，焦山六具，天都庙九具，炮勇三百馀人，以武威六营、新湘三旗驻防。金陵城外炮台七处，曰乌龙山，曰幕府山，曰下关，曰狮子山，曰富贵山，曰清凉山，曰雨花台。乌龙山在省城外四十里，於南岸分设五台，置炮十二具，炮勇一百馀人。幕府山在北门外，炮台依次置炮七具，迤西老虎山置炮四具，炮勇一百馀人。下关炮台在城外东面对岸，东岸置炮二具，西岸置炮十具，炮勇一百馀人。狮子山在城内，分设东西二台，置炮八具，炮勇九十人。富贵山在锺山之麓，置炮六具，炮勇四十馀人。清凉山在西门内，依城为炮台，置炮二具，炮勇十四人。雨花台在聚宝门外，置炮二具，炮勇十四人。
安徽省炮台分为四路，曰东西梁山，曰拦江矶，曰前江，曰棋盘山。梁山夹江对峙，东台置炮十四具，西台十二具，以精锐营步兵三哨为炮兵。拦江矶炮台在省城外四十里西岸，置炮十五具，以续备步队中营驻台为炮兵。前江口炮台在上游十馀里，踞东岸高阜，分上下二台，置炮十二具，由续备中营拨兵分驻。棋盘山炮台在安庆东门外北岸，置大小炮六十八具，以步兵前营驻防。
江西省炮台分为四路，曰马当，曰湖口，曰金鸡坡，曰岳师门。马当在彭泽县东南岸，分设五台，置炮五具，炮勇六十人。湖口炮台在县城北之东西岸，分设二台，置炮十具，炮勇七十人。金鸡坡炮台在九江府十里外东西岸，分设三台，列东西北三面，置炮十二具，炮勇二百人。岳师门炮台在九江东门外，分上下二台，沿江岸建筑，置炮二十一具，炮勇七十人。
湖北省炮台，仅田家镇一路，分中南北三台，置炮三十一具，炮勇五十人。