《释骨》一卷。沈彤撰。
《杂病源流》三十卷。沈金鼇撰。
《温证语录》一卷。喻昌撰。
《广温热论》五卷。戴天章撰。
《温热论》一卷。薛雪撰。
《瘟疫传症汇编》二十卷。熊立品撰。
《温疫条辨摘要》一卷。吕田撰。
《松峰说疫》六卷。刘奎撰。
《温热经纬》五卷。王士雄撰。
《温症痧辨证》一卷。许汝楫撰。
《痧胀玉衡书》三卷，《后书》三卷。郭志邃撰。
《治疟痢方》一卷。倪涵初撰。
《痢疾论》四卷。孔毓礼撰。
《痧法备旨》一卷。欧阳调律撰。
《霍乱论》二卷。陈念祖撰。
《霍乱论》二卷。王士雄撰。
《吊脚痧方论》一卷。徐子默撰。
《喉科秘钥》二卷。许佐廷撰。
《烂喉〈疒丹〉痧辑要》一卷。金德鉴撰。
《时疫白喉捷要》一卷。张绍修撰。
《血症经验良方》一卷。潘为缙撰。
《傅青主男科》二卷，《女科》二卷，《产后编》二卷。傅山撰。
《济阴纲目》十四卷。武之望撰，汪淇笺。
《女科要旨》四卷。陈念祖撰。
《宁坤宝笈》二卷，《附》一卷。释月田撰。
《女科辑要》八卷。周纪常撰。
《妇科玉尺》六卷。沈金鼇撰。
《女科经论》八卷。萧埙撰。
《产科心法》二卷。江喆撰。
《产孕集》二卷。张曜孙撰。
《胎产护生编》一卷。李长科撰。
《达生编》一卷。亟斋居士撰。
《保生碎事》一卷。汪淇撰。
《幼科铁镜》六卷。夏鼎撰。
《雅爱堂痘疹验方》一卷。邵嗣尧撰。
《冯氏锦囊秘录杂症大小合参》二十卷，《痘疹全集》十五卷，《杂症痘疹药性合参》十二卷。冯兆张撰。
《痘疹不求人方论》一卷。朱隆撰。
《疹痘集解》六卷。俞茂昆撰。
《保童济世论》一卷。陈含章撰。
《痘证宝筏》六卷。强健撰。
《庄氏慈幼二书》二卷。庄一夔撰。
《幼科释谜》六卷。沈金鼇撰。
《幼幼集成》六卷。陈复成撰。
《天花精言》六卷。袁旬撰。
《牛痘要法》一卷。蒋致远撰。
《外科正宗评》十二卷。徐大椿撰。
《外科证治全生》一卷。王维德撰。
《治疔汇要》三卷。过铸撰。
《一草亭目科全书》一卷。邓苑撰。
《眼科方》一卷。叶桂撰。
《治蛊新方》一卷。路顺德撰。
《理瀹骈文》二卷。吴尚先撰。
《串雅》八卷，《祝由录验》四卷。赵学敏撰。
《药症宜忌》一卷。陈澈撰。
《医学三字经》四卷。陈念祖撰。
《慎疾刍言》一卷。徐大椿撰。
《勿药须知》一卷。尤垂撰。
《摄生间览》四卷。赵学敏撰。
《医故》二卷。郑文焯撰。
不知时代撰人《颅〈页〉经》二卷。
宋王衮《博济方》五卷。
宋沈括《苏沈良方》八卷。
宋董汲《脚气治法总要》二卷、《旅舍备要方》一卷。
宋韩祇《伤寒微旨》二卷。
宋王贶《全生指迷方》四卷。
宋夏德《卫生十全方》三卷、《奇疾方》一卷。
东轩居士《卫济宝书》二卷。
不知撰人《太医局程文》九卷。
《产育宝庆方》二卷。
宋李迅《集验背疽方》一卷。
宋严用和《济生方》八卷。
不知撰人《产宝诸方》一卷。
《救急仙方》六卷。
元沙图穆苏《瑞竹堂经验方》五卷。以上乾隆时敕辑。
《神农本草经》三卷。孙星衍、孙冯翼同辑。
《神农本草经》三卷。顾观光辑。
天文算法类
《历象考成》四十二卷。康熙五十二年，圣祖御撰。
《历象考成后编》十卷。乾隆二年敕撰。
《仪象考成》三十二卷。乾隆九年，戴进贤等奉敕撰。