广惠司。秩正三品。掌修制御用回回药物及和剂，以疗诸宿卫士及在京孤寒者。司卿四员，少卿二员《元典章》广惠司令，从六品。按本司有丞，必有令，旧志漏之。司丞二员，经历、知事、照磨各一员。延祐六年升正三品。其属：
大都、上都回回药物院二。秩从五品。掌回回药事。达鲁花赤一员，从五品。大使二员，副使一员，正七品。至元二十九年置。至治二年，拨隶广惠司。
御药院。秩从五品。掌受各路诸番进贡药品。达鲁花赤一员，从五品。大使二员，从五品。副使二员，正七品。直长一员，正八品。都监二员。正九品。至元六年置。
御药局。秩从五品。达鲁花赤一员，从五品。局使二员，从五品。副使二员。正七品。《元典章》御药局副提举、同提举，均从六品。行御药局。掌两都行箧药品。达鲁花赤一员，大使三员。品秩同上。大德九年置。
御香局。秩从五品。掌修合御用诸香。提点一员，从五品。司令一员。至大元年置。
大都惠民局。秩从五品。掌收官钱，出息修药剂，以惠贫民。提点一员，从五品。司令一员。正七品。中统二年置，受太医院札。至元十四年定。秩从六品。二十一年。从五品。
上都惠民局。提点一员，司令一员。中统四年置。《元典章》安西路惠民局提点，从五品，同知四川药材医局、惠民局，正五品。
医学提举司。掌考校诸路医生课艺。试验太医教官，校勘名医撰述文字，辨验药材。秩从五品。医学提举一员，从五品。副提举一员。从七品。至元九年置。十三年罢。十四年复置。
官医提举司。秩从五品。掌医户差役词讼。至元二十五年置。大都、保定、彰德、东平四路，设提举、同提举、副提举各一员。河间、大名、晋宁、大同、冀宁、广平、济宁、济南、辽阳、兴和十路，设提举、副提举各一员。卫辉、杯孟、大宁三路，设提举一员。此腹里路分官医捉举司，改隶于太医院。其河南等五省各立一司，隶于本省。
奎章阁学士院。秩正二品。大学士四员，正二品。侍书学士二员，从二品。承制学士二员，正三品。供奉学士二员，正四品。参书二员，从五品。典签二员，正七品。照磨一员，正八品。天历二年，立于兴圣殿西，命儒臣进经史之书，考帝王之治。置大学士二员，正三品。寻升为学士院。至顺二年，定置诸员如上。属官：授经郎二员，正七品。天历二年置。后至元六年罢奎章阁。至正元年立宣文阁，不置学士，惟授经郎及鉴书博士以宣文阁系衔。
群玉内司。秩正三品。掌奎章阁图书及常御之物。司监一员，正三品。司尉一员，从三品。亚尉一员，正四品。佥司一员，从四品。司丞一员。正五品。典薄一员，正七品。天历二年，更司籍郎，为秩正六品。群玉署，至顺元年升群玉内司，后至元元年罢。
艺文监。秩从三品。掌以国语译儒书及儒书之合校仇者。太监检校书籍事二员，从三品。少监同检校书籍二员，从四品。监丞参校书籍事二员，从五品。典簿一员，正七品。照磨一员。正八品。天历二年置，至元六年改崇文监，至正元年改隶翰林国史院。
监书博士。秩正五品。掌品定书画。博士二员。正五品。天历二年置。
艺林库。秩正六品。掌藏贮书籍。提点一员，正六品。大使一员，从六品。副使一员。正七品。天历二年置。
广成局。秩正七品。大使一员，从七品。副使二员，正八品。直长二员。正九品。掌传刻经籍。天历二年置。
侍正府。秩正二品。掌内廷近侍之事。侍正十四员，正二品。同知二员，正三品。参府二员，从三品。侍判二员，正四品。经历一员，从六品。都事一员，从七品。照磨一员。从八品。至大元年，立尚服院。秩从二品。三年升正二品。后省。至顺二年，置侍王府，领速古儿赤四百人、奉御二十四员。后至元元年，以待政府属微政院。
奉御二十四贞，秩从五品。尚冠二员，从五品。副奉御二员，从六品。尚衣奉御二员，副奉御二员，尚鞶奉御二员，副奉御二员，尚沫奉御二员，副奉御二员，尚饰兼尚辇奉御二员，正六品。副奉御二员，正七品。掌薄四员。从七品。以四怯薛之速古儿赤为之。至大元年，设尚冠、尚衣、尚鞶、尚沐、尚辇、尚饰六奉御，秩从五品。凡四十八员，隶尚服院。天历初，省为二十四员，改隶侍正府。
给事中。秩正四品。掌随朝省、台。院诸司凡奏闻之事，悉纪录之，如古左右史。给事中兼修起居注二员，正四品。右侍仪奉御同修起居注一员，左侍仪奉御同修起居注一员。从五品。《元典章》左、右待仪奉御，正四品。至元六年。置起居注、左右补阙。十五年，改给事中兼修起居注，左右补阙改为左右侍仪奉御兼修起居注。皇庆元年升正三品。延佑七年，仍详定正四品。后定置诸员如上。