至治三年，改赐金印，特授沙津爱护持，且命为诸国引进使。至顺二年，又赐玉印，加号普觉圆明广照弘辩三藏国师。是年，与安西王子月鲁帖木儿等谋为不轨，坐诛，其所译经。汉字则有《楞严经》，西天字则有《大乘庄严宝度经》、《乾陀般若经》、《大涅槃经》《称赞大第功德经》，西番字则有《不思议禅观经》，皆行于世。
邱处机，字通密，登州栖霞人，自号长春子。幼有人相之曰：“神仙宗伯也。”年十九，学全真道于宁海之昆仑山，与马钰、谭处端、刘处元、王处一、郝大通、孙不二，同师重阳王真人。马钰，宁海人，弱冠举进士。妻孙氏，名不二，亦宁海人。刘处元，掖县人，着有《道德经解》、《阴符经解》谭处端，宁海人，着有《云水前后集》王处一，宁海人。郝大通。宁海人。明谓之七真人，独处机名最着。金、宋之委，俱遣使召之，不赴。
太祖征西域，命近臣彻伯尔、刘仲禄赍玺书，请处机至军中。处机一日忽语其徒曰：“天使来召我，我当往。”翼日，二人至，处机乃与弟子十有八人同行，明年，留山北，先驰表谢，拳拳以止杀为戒。又明年、趣使再至，乃发抚州，经涉万有余里，历四载而始达于雪山。常马行积雪中，马上举策试之，未及积雪之半。既见，太祖大悦，赐食，设庐甚饬。
太祖方西征，日事攻战，处机每次言欲一天下者，必在不嗜杀人。及问为治之方，则对以敬天爱民。部长生久视之道，则告以清心寡欲。太祖深契其言，曰：“天锡仙翁，以？爨朕志。”命左右书之，且以训计算子焉。赐虎符，副以玺书，不斥其名，惟曰：“神仙”。一日雷震，太祖以问，处机对曰：“雷，天威也。人罪莫大于不孝，不孝则不顺笠天，故天威震动以警之。似闻境内不孝者多，陛下宜畏天威，明孝道治天，下。”大祖从之。
十七年，太祖大猎于东山，马踣，处机请曰：“天道好生，陛下春秋高，数畋猎，非宜。”太祖为罢猎者久之。时大兵践蹂中原，河南、北尤甚，民罹俘戮，无所逃命。处机还，使其待持牒购之。由是为人奴者得复为良，怀濒死而得更生者，毋虑二三万人。
十九年，荧惑犯尾，其占在燕，处机祷之，果退舍。二十一年，又为旱祷，期三日雨，当名瑞应，已而亦验。改赐宫名曰：“长春”，且遣使劳问，制曰：“朕常念神仙，神仙毋忘朕也。”六月，浴于东溪，越二日，天大雷雨，太液池水入东湖，声闻数里，鱼鳖尽去，池遂涸，而北口高岸亦崩。处机叹曰：“山其摧乎，池其涸乎，吾将与之俱乎！”遂卒，年八十。其徒尹志平等，世奉玺书，袭掌其教。
至大二年，加赐金印，处机赠为长春全德神化明应直君，马钰为丹阳抱一无为普化真君，谭处端为长真凝神元静蕴德真君，刘处元为长生辅化宗元明德真君，王处一为玉阳体元广慈普度真君，郝大通为广宁通元妙太古真君，孙不二为清净渊真虑元顺化元君，敕并会道士苗道一收执。处机弟子十八人，知名者尹志平、李志常、宋德芳、綦志远，并封真人。
时又有康泰真者，利州人。母娠二十四月而生。学道于王重阳，与邱处机、马钰人游。四方之士，踵门受业者，恒数百人。夏大旱，使者请祈雨，泰真端坐久之，曰：“明日雨。”既而果然。冬常裸十余日，无寒色。卒年九十余。
处机第四传曰祁志诚，居云金阁山，誉问甚着。丞相安童尝过而问之。志诚告以修身治世之要。安单感其言，故相世祖，以清静为本。及罢相，退然若无与于世者，人谓有得于志诚之言。
正一天师者，始自汉张道陵，勘探后四世孙来居信州之龙虎山。相傅至三十六世宗演，当至元十三年，世祖已平江南，遣使召之。至则命廷臣效劳，待以客礼。及见，语之曰：“昔岁已未，朕次鄂渚，尝令王一清往访卿，卿父使报塍朕曰：“后二十年天下当混一。神仙之言验于念矣。”因命坐，赐宴，特赐玉芙蓉冠、组金无缝服，赐号演道灵应冲和真人，命主领江南道教，仍赐银印。
十八年、二十五年再八觐。世祖尝命敢其祖天师所传玉印、宝剑观之，语侍臣曰：“朝代更易已不知其几，而天师剑印传子若孙尚至今日，其果有神明相之乎！”嗟叹久之。其实天师玉印文曰“阳平治都君所”，乃宋徽宗所赐，非汉印也。
九月，都功德使司脱因小演赤奏：“曩者所毁道家伪经板本化图，多隐匿未毁，其书皆底毁释教之言，宜甄别。”于是命前中书右丞张文廉等诣长春宫无极殿，着，余悉汉张道陵、后魏寇廉之等伪作。文廉等奏：“自《道德经》外，宜悉焚毁。”帝曰：“道家经文，传讹踵廖非一日矣。若焚之，其徒未必心服。彼言水火不能焚溺，可以是端试之。候不验，焚之未晚也。”遂谕宗演等，俾推择人入火试其术。宗演等奏：“此皆诞妄之说，臣等入火，必皆为灰烬，实不敢试。但乞焚去《道藏》伪书，庶几澡雪臣等。”帝可其奏。遂诏天下道家诸经，可留道德二施篇，其余一切焚毁，匿藏者罪之。十月，集百官于愍忠寺，焚毁《老子化胡经》、《犹龙传》等书。