已而伯颜与平章政事札散、右丞麦术丁等奏：“海运之事，两南人言，胡廷若付脚钱，愿以私力，岁各运十万石至京师，乞与职名。臣等议：朱清原有金牌，今授中万户。换虎符，张招讨之子，现带银牌，换金牌为千户，忙兀斛现带金虎符为一府达鲁花赤，余一府以万户之无军而带虎符者为达鲁花赤。“从之。
二十一年，右丞麦术丁等奏：“斡奴鲁、忙兀斛三次文书言：‘阿八赤新开河，损多益少，无济漕运，其水手军人等二万、艘千般俱闲不用，乞忖臣等岁运粮一百万石。’臣等前奉敕与忙兀斛议行海运，今己送粮回讫。又朱清等各愿粮运十万石。又囊家歹孙万户请得此船，与军人、水手以充海运。臣于伯颜等议：以阿八赤河道所用水手五千、兵五千、船一千艘付扬州行省，教习海运。其余水手五千、兵五千就驾平滦船，从利淖海道运根。”从之。遂罢阿八赤所开河。
二十二年二月，参政不鲁迷失海牙等奏：“自江南每岁运粮一百万石，从海追运者十万石，从阿八赤、乐二人新挑河道运者六十万石，从奥行赤所挑济州河实道运者三十万石。今阔阔你敦等言：济州河追船缺。臣等议，令三省造船三千艘以济运。”从之。
二十三年，又以征日本所造船给沿海居民运稂，用平章阿必失哈、参政秃鲁花之议也。是年，平章薛彻干等奏海边运粮四年，凡一百万石，至京师者八十四万石，不至者一十七万石。运者育：“江南斗小，至此斗大，以此折耗者有之。又因船坏弃米有之，已责令赔偿矣。若人船俱没，不知应赔否？”上曰：“没于水，安能使赔。其免之。”
二十四年，立行泉府司，专领海运，增置万户府二，总为四万户府。都漕运海船上万户府，亦速为首，与张文龙等勾当。平江等处运粮万户府，忙兀斛为首，与费拱辰、张文彪等勾当。孛兰奚等海道运粮万户府。与朱虎等勾当。是年，始罢东平河运，专用海运矣。
二十五年，丞相桑哥，平章铁木儿、呵鲁浑彻里等奏，“住者岁运江南粮一百万石，在后止运七十万石。今养济百姓用粮多，宜增运一百万石。”从之。是年二月，分且漕司二。《百官志》作二十四年。都漕运使司于河西务置司，自济州东阿起，并御河上下，至直沽、河西务、李二寺、通州、坝河等处，水陆攒运，接运海追粮及各仓一切公本，并隶本司管领。京畿都漕运使司站车赴各仓运粮，本司先将半印勘合，支簿开发，都漕运使司收管，然后押印勘合关文，开坐所运粮数交押运官赍住都漕运使司投下，比对元发半印号簿相同，都漕运使司亦同勘合下仓支拔交装。毋致刁蹬停滞。就取押运官明白收管，随即具交装讫粮数，行移京畿都漕运司使照会，行下省仓，依数受管。仍勒押运官须用心关防车户般运交纳，如有短少，即追赔数足，及取押运官招伏治罪。都漕运便司凡支粮并船人粮马料，须依例置立勘合号簿，明白书填押印勘合文帖，下仓放支。非奉省部明文。勿得擅支。京畿清运使司应管各仓分收支见在，并趱运粮旬申月数目，及应觑各仓关防事理，仰户部照例行下本司，须依例申部呈省。
二十七年，丞相桑哥等奏：“自江南每运来者，薛彻秃、孛兰奚、朱、张等万户及千户、百户今岁勤劳尤甚，乞每人赐衣一袭一上曰。”南人爱毳段，其各赐毳段一端。”二十八年八月，平章不忽木等奏：“海边运粮，朱清张瑄万户言：‘往岁运粮，止以臣等二万户府，自去年隶泉府司，沙不丁再掭二万户运粮，百姓艰难，所有折耗，俱责臣等。乞胡廷伶悯，罢二府，或委他人。’”上曰：“彼所言是也。止令二府运之。“又奏：“朱张二万户，‘或有疑臣等者，乞留臣等在此，令臣之子代运。’”上曰，“安用如此，止以朱张二万户运之。“是月，并海边都漕运为二万户府，张瑄以骠骑卫上将军、淮东边宜慰使效领海追都漕运万户府事，朱清以骠骑卫上将军、江东边宣慰使兼领海追都漕运万户府本。张瑄管领，每年以十分为率，该运六分；朱清每年以十分为率，该运四分。
二十九年，平章政事不忽木、阇里等奏：“淮海艄工、水手人等，选择可用者，雇直如例给之，每户妻子以五口为率，给以粮，免其杂泛差役。”从之。三十年，以朱文龙为海漕都漕万户，赐虎符，捉调香糯事，设千户一，百户三。
元贞元年，丞相完泽、平章赛典赤等奏：“朱、张海运，往岁一百万石，或增其数。如岁不登，百姓艰食，实赖海运济之。豪、懿等州并商丽境，连年饥馑，亦仰运粮赈济。今岁丰米贱，若仍前海运，切恐未宜。去岁会计，只运三十万石。今应如上年例，亦运三十万百。”又奏：“每年海运，以十分为卒，张万户运六分，朱万户运四分。今朱万户言，乞均分停运。“并从之。二年，谕行省、行台诸司，毋沮坏海边运粮都漕运万户事，违者罪之。