屋肯哀丁遁入起儿漫，居半载，率众至合而拉耳，蒙古将台马司台纳尔来攻，败走苏吞阿盆脱堡，攻半年，堡破，杀之。
王母土而堪哈敦，居乌尔鞬赤。太祖自撒马尔干遣使者丹尼世们往，谓：“哈敦之子，不孝于母，开罪于我，我欲得而甘心焉。哈敦所主地，我不相犯，速遣亲信人来与面议。”土而堪置不答，而遁去。以兼并诸部落故酋皆居旧都，恐为变，悉投之阿母河。凡杀忒耳迷酋、八迷俺酋、斡克石酋、巴而黑酋父子、塞而柱克王托古洛耳二子、郭耳酋马赫模特二子、雪格纳克酋二子。惟倭马尔酋未杀，使导行，仍害之中途。土而堪入马三德兰伊拉耳堡，哲、速二将追西域主经其堡，知土而堪在内，留军绝其汲道，逾月不雨，堡民渴欲死，乃出降。当夕即雨。以王母、妻送太祖军中，杀其幼孙。土而堪后随大军东返，太宗六年卒于和林。
札剌勒丁与二弟既藁葬其父，由芒格世拉克之地至乌尔鞬赤。城兵六万多康里人，闻札剌勒丁嗣位，皆不服，谋杀之。事觉，札剌勒丁与帖木儿玛里克以三百骑出奔，南逾沙漠，入呼拉商。遇游兵七百人于讷萨城，败之。将至你沙不儿，大兵追及，令其将拒战，自从间道逸去。迨败退，札剌勒丁已去久，追者乃止。札剌勒丁出奔后三日，大兵至乌尔鞬赤，鄂斯拉克沙、阿克沙不能守，亦出奔。至讷萨，遇游兵，避入喀仑特耳堡。堡人出战，令乘间遁去。行抵勿世特之地，又有游兵自他道至，杀之。惟札剌勒丁得脱，由海拉脱东南，遁人嘎自尼。
太祖既定撒马尔干，夏，避暑于渴石。秋，命术赤、察合台、窝阔台攻乌尔鞬赤，自将大军至忒耳迷，呼城人开门纳降，不应。攻十日，破之，大杀掠。一老妇有大珠，不肯献，而吞于口，剖其腹取之。于是，死者多遭剖腹。至赛蛮，分军入巴达克山，命拖雷将兵往呼拉商，为哲别、速不台后援，平其未定之地。阿母河北悉定，遂渡河。巴而黑城迎降，太祖以将南行，恐留为后路患，令民悉出城，焚其庐舍。遂由塔里堪山中，攻诺司雷脱柯寨，守兵溃遁，屠而隳之。
十六年夏，术赤、察合台、窝阔台攻乌尔鞬赤，城民举库马尔为首领。前锋至，守兵出战，中伏，大败。术赤下令军中禁焚掠，言：“我父将以此地封我。”遣使招降。初，西域主谕城民：力不能御蒙古，任民降敌纾祸，而守将不愿降蒙古，遂坚守。近城无石，伐大木为冲车，填城濠而进。城跨阿母河，为桥以通往来，遣兵断其桥。三千人往，皆战殁，守者益胆壮。术赤、察合台素有违言，师不和，阅六月不克，使人告太祖于塔里堪。太祖廉得其实，改命窝阔台总诸军，乃调和两兄，并力攻城。城破后，巷战七昼夜，民始降。既而，悉戮之，惟工匠、妇女、幼稚得免。决河水浸其城。察合台、窝阔台赴塔里堪会师，术赤仍驻咸海、里海间。
拖雷一军，以脱忽察儿为前锋，渡阿母河至讷萨，攻半月克之，恣行屠戮。驻三日，往喀仑特耳堡，以险峻不易下，令献衣裘万袭以免。至你沙不儿城，城兵射死脱忽察儿，别将代统其众。以兵少，不攻城。分二军：一军攻克萨伯自洼，一军至徒思，降其属堡。
马鲁者，塞而柱克之故都也。哲、速军至，马鲁守将巴哈夷倭儿先遁，马鲁民约降。其守将木直而倭儿从西域主西奔，王卒，回至马鲁，议守御。民之不欲降者，奉为城主，士卒亦归之。其欲降者，惧祸及，告于昔剌思大军：“巴哈夷倭儿已降，请往收其地。”助以兵而行，至则尽为所杀。
十六年春正月，拖雷下安狄枯城，遂讨马鲁，先逐城外突厥人，奋力攻城。木直而倭儿知不支，乃乞降。大军入城，并其亲族杀之，城民惟工匠、妇女，童稚得免，发塞而柱克王散者耳之墓。西讨你沙不儿城，有炮军三千，炮五百，拖雷亦以炮军三千人运石至，辅以云梯、火箭，百计环攻。乞降，不允。三月，城破，脱忽察儿之妇率万人入城，遇人畜悉杀，以报夫仇。拖雷闻人伏积尸中，令悉断其首，分男女髑髅堆二阜，惟工匠四百人未死。分军毁徒思城外哈里发墓。自苦亦斯单至海拉脱，力攻八日，两军死伤甚众，守将亦战殁。民乃请降，惟诛守兵万二千人。旋奉太祖命，东往塔里堪会师。
太祖以札剌勒丁居嘎自尼未下，议率三子新征。秋，自塔里堪南行，经凯而徒俺城，下之。逾印度固斯大山，至八米俺，以其城当冲要，留攻之。命失吉忽都虎东南往喀不尔山，阻札剌勒丁旁抄之兵。