当札剌勒丁之奔嘎自尼也，其地数有内乱，守将迭被杀。札剌勒丁至，众情推戴，复有西域主母弟阿敏玛里克、库拉起人赛甫曷丁阿格拉克率众助之，喀不尔土人亦起兵相应，有众六七万。闻大军南来，御之巴鲁安。遇蒙古兵攻堡者，败之，杀千人。越八日，失吉忽都虎至，战竟日，互有胜负。次日，再战。札剌勒丁先使兵下马以待，战酣，齐令上马冲突，失吉忽都虎大败而退。
阵获一骏马，二将争欲之，阿敏以马策挝阿格拉克之面，札剌勒丁以其为王母弟，不能禁抑。阿格拉克怒，率库拉起人去之，喀不尔众亦散。札剌勒丁无如之何，乃还至嘎自尼，复退至印度河。
太祖攻八米俺，皇孙谟阿图堪死之，太祖怒屠其城。失吉忽都虎既败，太祖卷甲南行，军中不及炊，皆啖生米。至嘎自尼，则札剌勒丁已去。仍疾追之，及于印度河。札剌勒丁屡招阿格拉克等来助，犹未至，而太祖追及。闻其欲渡河，即夕列阵围之。晓而战，先败其右翼，获阿敏玛里克，杀之。未几左翼亦败，中军仅七百人，犹死战。太祖欲生禽札剌勒丁，命诸将环攻，勿发矢。札剌勒丁策其马，自数丈高崖投入印度河，泅水而逸。获札剌勒丁妻、子，尽杀之。时十六年冬也。
寻遣巴剌、土尔台渡印度河追之，破壁耶堡，躏轹木而滩、拉火耳、费耳沙波儿、蔑里克波儿等地，不知札剌勒丁所在，攻木而滩城未下，大暑，遂班师。
十七年春，以札剌勒丁未获，军退后，嘎自尼民必复叛，命窝阔台往，伪为查阅户口，令民出城，尽戮之，取工匠从军。巴鲁安之败，海拉脱城亦叛，命按只吉歹往攻之，六月城始下，屠之。师旋，恐有遗孽，复遣兵突往，再杀二千人，惟十六人以乡居得免。
太祖自循印度河西岸北行，捕札剌勒丁馀党。时阿格拉克与他族相仇杀，先死。诸部悉平。窝阔台既定嘎自尼，请进兵昔义斯单，太祖以天暑止之。是夏，太祖避暑于巴鲁安，巴拉等自印度来会。六月，以西域大定，设达鲁花赤监治其地。
秋，旋师。窝阔台来会于古南柯而干。自此渡阿母河，历布哈尔，召天方教士曷世哀甫等二人来见，详述教规。太祖谓：“所言亦是，惟赴麦哈礼拜，我不谓然，上帝降鉴，无在不周，何为拘拘一地？”令此后祈祷文用己名，免教士赋役。渡锡尔河，令西域主母妻及其亲族辞故土，向国而哭。
哲别、速不台既迫西域主入海岛，复获王之母妻，由马三德兰南至义拉克，所向无前。降合而拉耳，掠枯姆，定哈马丹，下赞章。破可斯费音，以民坚守，多伤士卒，杀四万人。北入西域之邻部，曰阿特耳佩占。部酋鄂思贝克年老，不敢御，迎馈衣马，二将纳其降。以部内莫干之地饶水草，遂驻冬。角儿只闻大敌近境，亟谋设备，不知阿特耳佩占已降，无斗志，遣使约鄂思贝克，明春合力夹攻蒙古。而是冬，二将即往角而只。鄂思贝克之将阿库世反为前锋，突厥人、库而忒人皆从征，钞掠其境。未及帖费利司，角儿只人来御，阿库世战不利，大军继进，败之。南还，再经台白利司，进攻梅拉喀，数日，城破，大杀掠。
欲从梅拉喀往哀而陛耳，以山路险隘，改而南行。报达哈里发那昔尔闻警，征哀而陛耳、毛夕耳、美索卜塔米牙各部兵，仅哀而陛耳、毛夕耳兵至。大军闻有备，亦退至哈马丹，征民贡献。民以去年已输纳，不堪需索，遂杀留守官以叛。大军攻城两日，守将遁，民无固志，城破，纵兵大掠。
北行，破爱而达必尔城。又西至台白利司，鄂思贝克畏而遁去，守将纳币请成。复北下赛拉白城。遣使招下阿而俺之贝列堪城，使人被害，破其城而屠之。西北入角儿只，复败其众。
时哲、速二将已奉太祖命北征奇卜察克，以角儿只境内多山险，不欲假道，退而东行，渡库耳河，破失儿湾之沙马起城。又破得耳奔特。失儿湾部酋拉施忒守山堡未下，二将令以乡导人来，即罢攻。拉施忒遣十人至，以不善导军，杀一人以徇。遂逾高喀斯山而北。
太祖东归，定四子分地，以和林封拖雷，以叶密尔河滨之地封窝阔台，以锡尔河东之地封察合台，以咸海西南货勒自弥之地，并咸海、里海之北，封长子术赤。