镇守云南总兵官一人，旧设，驻云南府。分守参将三人，(曰临元参将，曰永昌参将，曰顺蒙参将，守备二人。)巡抚中军坐营官一人。
镇守贵州总兵官一人，旧设，嘉靖三十二年，加提督麻阳等处地方职衔，驻铜仁府。分守参将二人，(曰提督清浪右参将，曰提督川贵迤西左参将。)守备七人，巡抚中军官一人。
镇守广西总兵官一人，旧为副总兵，嘉靖四十五年改设，驻桂林府。分守参将五人，(曰浔梧左参将，曰柳庆右参将，曰永宁参将，曰思恩参将，曰昭平参将。)守备三人，坐营官一人。
镇守湖广总兵官一人，旧设，嘉靖十年罢，十二年复设，万历八年又罢，十二年仍复设，驻省城。分守参将三人，(曰黎平参将，曰镇参将，曰郧阳参将。)守备十一人，把总一人。
镇守广东总兵官一人。旧为征蛮将军、两广总兵官。嘉靖四十五年分设，驻潮州府。协守副总兵一人，(潮漳副总兵，万历三年添设，驻南澳。)分守参将七人，(曰潮州参将，曰琼崖参将，曰雷廉参将，曰东山参将，曰西山参将，曰督理广州海防参将，曰惠州参将。)练兵游击将军一人，守备五人，坐营中军官二人，把总四人。
提督狼山副总兵一人，嘉靖三十七年添设，驻通州。镇守江南副总兵一人，旧系总兵官，驻福山港，后移驻镇江、仪真二处。嘉靖八年裁革。十九年复设。二十九年仍革。三十二年，改设副总兵，驻金山卫。四十三年移驻吴淞。分守参将二人，(曰徐州参将，曰金山参将。)游击将军一人，守备六人，凤阳军门中军官一人，把总十三人。
镇守浙江总兵官一人，嘉靖三十四年设，总理浙直海防。三十五年，改镇守浙直。四十二年，改镇守浙江，旧驻定海县，后移驻省城。分守参将四人，(曰杭嘉湖参将，曰宁绍参将，曰温处参将，曰台金严参将。)游击将军二人，总捕都司一人，把总七人。
分守江西参将一人，(曰南赣参将，嘉靖四十三年改设，驻会昌县。)守备四人，把总六人。
镇守福建总兵官一人，旧为副总兵，嘉靖四十二年改设，驻福宁州。分守参将一人，(曰南路参将)守备三人，把总七人，坐营官一人。
镇守山东总兵官一人，天启中增设。总督备倭都司一人，领蓟镇班都司四人。又河南守备三人，领蓟镇班都司四人。
总督漕运总兵官一人。永乐二年，设总兵、副总兵，统领官军海运。后海运罢，专督漕运。天顺元年又令兼理河道。协同督运参将一人，(天顺元年设)把总十二人，(南京二，江南直隶二，江北直隶二，中都一，浙江二，山东一，湖广一，江西一。)
留守司。正留守一人，(正二品)副留守一人，(正三品)指挥同知二人。(从三品)其属，经历司，经历，(正六品)都事。(正七品)断事司，断事，(正六品)副断事，(正七品)吏目各一人。掌中都、兴都守御防护之事。洪武二年，诏以临濠为中都，置留守卫指挥使司，隶凤阳行都督府。十四年，始置中都留守司，统凤阳等八卫，(凤阳卫，凤阳中卫，凤阳右卫，皇陵卫，留守左卫，留守中卫，长淮卫，怀远卫。)防护皇陵，设留守一人，左、右副留守各一人。(属官经历以下，如前所列。)嘉靖十八年，改荆州左卫为显陵卫，置兴都留守司，统显陵、承天二卫，防护显陵，设官如中都焉。
都指挥使司。都指挥使一人，(正二品)都指挥同知二人，(从二品)都指挥佥事四人。(正三品)其属，经历司，经历，(正六品)都事。(正七品)断事司，断事，(正六品)副断事，(正七品)吏目各一人。司狱司，司狱。(从九品)仓库、草场，大使、副使各一人。行都指挥使司，设官与都指挥使司同。
都司，掌一方之军政，各率其卫所以隶于五府，而听于兵部。凡都司并流官，或得世官，岁抚、按察其贤否，五岁考选军政而废置之。都指挥使及同知佥事，常以一人统司事，曰掌印，一人练兵，一人屯田，曰佥书。巡捕、军器、漕运、京操、备御诸杂务，并选充之，否则曰带俸。凡备倭守备行都指挥事者，不得建牙、升公座。凡朝廷吉凶表笺，序衔布、按二司上。经历、都事，典文移。断事，理刑狱。
明初，置各行省行都督府，设官如都督府。又置各都卫指挥使司。洪武四年，置各都卫断事司，以理军官、军人词讼。又以都卫节制方面，职系甚重，从朝廷选择升调，不许世袭。七年，置西安行都卫指挥使司于河州。八年十月，诏各都卫并改为都指挥使司，凡改设都司十有三，(燕山都卫为北平都司，西安都卫为陕西都司，太原都卫为山西都司，杭州都卫为浙江都司，江西都卫为江西都司，青州都卫为山东都司，成都都卫为四川都司，福州都卫为福建都司，武昌都卫为湖广都司，广东都卫为广东都司。广西都卫为广西都司，定辽都卫为辽东都司，河南都卫为河南都司。)行都司三，(西安行都卫为陕西行都司，大同都卫为山西行都司，建宁都卫为福建行都司。)十五年，增置贵州、云南二都司。后以北平都司为北平行都司。永乐元年改为大宁都司。宣德中，增置万全都司。计天下都司凡十有六。(十三省都司外，有辽东、大宁、万全三都司。)又于建昌置四川行都司，于郧阳置湖广行都司。计天下行都司凡五。
明初，又于各行省置都镇抚司，设都镇抚，(从四品)副镇抚，(从五品)知事。(从八品)吴元年改都镇抚正五品，副镇抚正六品，知事为提控案牍，省注。洪武六年罢。
卫指挥使司，设官如京卫。(品秩并同)外卫各统于都司、行都司或留守司。率世官，或有流官。凡袭替、升授、优给、优养及属所军政，掌印、佥事报都指挥使司，达所隶都督府，移兵部。每岁抚、按察其贤否，五岁一考选军政，废置之。凡管理卫事，惟属掌印、佥书。不论指挥使、同知、佥事，考选其才者充之。分理屯田、验军、营操、巡捕、漕运、备御、出哨、入卫、戍守、军器诸杂务，曰见任管事；不任事入队，曰带俸差操。征行，则率其属，听所命主帅调度。
所，千户所，正千户一人，(正五品)副千户二人，(从五品)，镇抚二人，(从六品)其属，吏目一人。所辖百户所凡十，共百户十人，(正六品。升授、改调、增置无定员。)总旗二十人，小旗百人。其守御千户所，军民千户所设官并同。凡千户，一人掌印，一人佥书，曰管军。千户、百户，有试，有实授。其掌印，恒以一人兼数印。凡军政，卫下于所，千户督百户，百户下总旗、小旗，率其卒伍以听令。镇抚无狱事，则管军，百户缺，则代之。其守御千户所，不隶卫，而自达于都司。凡卫所皆隶都司，而都司又分隶五军都督府。(浙江都司、山东都司、辽东都司，隶左军都督府。陕西都司、陕西行都司、四川都司、四川行都司、广西都司、云南都司、贵州都司，隶右军都督府。中都留守司、河南都司，隶中军都督府。兴都留守司、湖广都司、湖广行都司、福建都司、福建行都司、江西都司、广东都司，隶前军都督府。大宁都司、万全都司、山西都司、山西行都司，隶后军都督府。)