梁元帝平侯景，召僧垣赴荆州，改授晋安王府谘议。其时虽克平大乱，而任用非才，朝政混淆，无复纲纪。僧垣每深忧之，谓故人曰："吾观此形势，祸败不久。今时上策，莫若近关。"闻者皆掩口窃笑。梁元帝尝有心腹疾，乃召诸医议治疗之方。咸谓至尊至贵，不可轻脱，宜用平药，可渐宣通。僧垣曰："脉洪而实，此有宿食。非用大黄，必无差理。"梁元帝从之，进汤讫，果下宿食，因而疾愈。梁元帝大喜。时初铸钱，一当十，乃赐钱十万，实百万也。
及大军克荆州，僧垣犹侍梁元帝，不离左右。为军人所止，方泣涕而去。寻而中山公护使人求僧垣。僧垣至其营。复为燕公于谨所召，大相礼接。太祖又遣使驰驿征僧垣，谨固留不遣。谓使人曰："吾年时衰暮，疹疾婴沉。今得此人，望与之偕老。"太祖以谨勋德隆重，乃止焉。明年，随谨至长安。武成元年，授小畿伯下大夫。
金州刺史伊娄穆以疾还京，请僧垣省疾。乃云："自腰至脐，似有三缚，两脚缓纵，不复自持。"僧垣为诊脉，处汤三剂。穆初服一剂，上缚即解；次服一剂，中缚复解；又服一剂，三缚悉除。而两脚疼痹，犹自挛弱。更为合散一剂，稍得屈申。僧垣曰："终待霜降，此患当愈。"及至九月，遂能起行。
大将军、襄乐公贺兰隆先有气疾，加以水肿，喘息奔急，坐卧不安。或有劝其服决命大散者，其家疑未能决，乃问僧垣。僧垣曰："意谓此患不与大散相当。若欲自服，不烦赐问。"因而委去。其子殷勤拜请曰："多时抑屈，今日始来。竟不可治，意实未尽。"僧垣知其可差，即为处方，劝使急服。便即气通，更服一剂，诸患悉愈。
天和元年，加授车骑大将军、仪同三司。大将军、乐平公窦集暴感风疾，精神瞀乱，无所觉知。诸医先视者，皆云已不可救。僧垣后至，曰："困则困矣，终当不死。若专以见付，相为治之。"其家忻然，请受方术。僧垣为合汤散，所患即瘳。大将军、永世公叱伏列椿苦利积时，而不废朝谒。燕公谨尝问僧垣曰："乐平、永世俱有痼疾，若如仆意，永世差轻。"对曰："夫患有深浅，时有克杀。乐平虽困，终当保全。永世虽轻，必不免死。"谨曰："君言必死，当在何时？"对曰："不出四月。"果如其言。谨叹异之。六年，迁遂伯中大夫。
建德三年，文宣太后寝疾，医巫杂说，各有异同。高祖御内殿，引僧垣同坐，曰："太后患势不轻，诸医并云无虑。朕人子之情，可以意得。君臣之义，言在无隐。公为何如？"对曰："臣无听声视色之妙，特以经事已多，准之常人，窃以忧惧。"帝泣曰："公既决之矣，知复何言！"寻而太后崩。其后复因召见，帝问僧垣曰："姚公为仪同几年？"对曰："臣忝荷朝恩，于兹九载。"帝曰："勤劳有日，朝命宜隆。"乃授骠骑大将军、开府仪同三司。又敕曰："公年过县车，可停朝谒。若非别敕，不劳入见。"四年，高祖亲戎东讨，至河阴，遇疾，口不能言；睑垂覆目，不复瞻视；一足短缩，又不得行。僧垣以为诸藏俱病，不可并治。军中之要，莫先于语。乃处方进药，帝遂得言。次又治目，目疾便愈。末乃治足，足疾亦瘳。比至华州，帝已痊复。即除华州刺史，仍诏随入京，不令在镇。宣政元年，表请致仕，优诏许之。是岁，高祖行幸云阳，遂寝疾。乃诏僧垣赴行在所。内史柳昂私问曰："至尊贬膳日久，脉候何如？"对曰："天子上应天心，或当非愚所及。若凡庶如此，万无一全。"寻而帝崩。
宣帝初在东宫，常苦心痛。乃令僧垣治之，其疾即愈。帝甚悦。及即位，恩礼弥隆。常从容谓僧垣曰："常闻先帝呼公为姚公，有之乎？"对曰："臣曲荷殊私，实如圣旨。"帝曰："此是尚齿之辞，非为贵爵之号。朕当为公建国开家，为子孙永业。"乃封长寿县公，邑一千户。册命之日，又赐以金带及衣服等。
大象二年，除太医下大夫。帝寻有疾，至于大渐。僧垣宿直侍疾。帝谓随公曰："今日性命，唯委此人。"僧垣知帝诊候危殆，必不全济。乃对曰："臣荷恩既重，思在效力。但恐庸短不逮，敢不尽心。"帝颔之。及静帝嗣位，迁上开府仪同大将军。隋开皇初，进爵北绛郡公。三年卒，时年八十五。遗诫衣白帢入棺，朝服勿敛。灵上唯置香奁，每日设清水而已。赠本官，加荆、湖二州刺史。