王莽自从篡位以后，知道太后心中怨恨，就想尽了一切办法去奉承太后，然而太后却越来越不高兴了。王莽更改了漠家侍中穿黑貂的制度，侍中都身着黄貂，又改变了汉家正朔之和伏腊日的日期。太后让自己的手下人都身穿黑貂，每到汉朝的元旦和腊曰，就特意和身边的侍者对坐饮酒食以示不忘汉朝。
太后八十四岁那年，也就是在建国五年二月癸丑逝世。三月乙酉，和元帝合葬于渭陵。王莽下诏让大夫扬雄写成祭文说： “太阴之精，沙麓之灵，天合于汉，配元生成。”显示出她正与元城沙麓相合。太阴之精，是说太后乃梦月而生。太后谢世十年后，汉兵诛灭了王莽。
当初，红阳侯王立回到封地南阳，和那些刘氏子弟结下恩情，王立的小儿子王丹做了中山太守。世祖光武帝刚刚起兵的时候，王丹归降他做了将军，作战而死。世祖非常怜悯他，就封他的儿子王泓为武桓侯，这个爵位一直传到现在。
司徒掾班彪说：自从三代以来，《春秋》所记载的，王公、国君，他们灭亡的原因，很少有不是因为受宠爱的女子造成的。汉代兴起之后，后妃的家族吕氏、霍氏、上官氏，好几次险些倾危国家。等到王莽兴起，是由于孝元后经历了汉朝四代天子，母仪天下，在位六十多年，她的弟弟们相继掌权，把持朝政，一共封了五个将军，十名列侯，终于由新都侯王莽实现了野心。朝代都已经改变了，可是元后还忠心耿耿手握一方传国玺，不想交给王莽，妇人之仁，真是可悲啊！