九月,杭州城寇大出,由蛮头山、凤凰山、九耀山、雷峰塔犯我军新垒,蒋益澧督诸军迎击,大破之。我军进壁天马山、南屏山、翁家山。时杭寇凶狡者,以邓光明、汪海洋为最,陈炳文次之。其计以杭州为老巢,以馀杭为犄角,均赖嘉兴、湖州之援,便资其接济。嘉兴入杭之路,则在馀杭,故我军议先克馀杭,扼截嘉、湖之路,以并合围。蒋益澧一军逼紥凤山、清波各门,扼其西面;馀杭一城已围其东南,而北路无重兵,两城之寇往来如故。
寇自大桥角战败,势渐蹙。秀成纠无锡、溧阳、宜兴贼八九万、船千馀艘,泊运河口;而自率悍党踞金匮县后宅,连营互进。李鹤章谓寇以河为固,不宜浪战,宜结营制之。我军叠败坊前、梅村、安镇、鸿山之寇,而寇之大股全集西路,志在保无锡以援苏州。郎中潘增玮进攻蠡口、黄埭之策,程学启乃与戈登攻破蠡口,进击黄埭,毁其四垒,擒斩伪天将万国镇。五龙桥者在宝带桥西五里,由澹台湖鲇鱼口达太湖以通浙之要隘也。学启率戈登会水师先后破寇六营。於是我军紥永安桥而娄门路断,紥宝带桥而葑门路断,克五龙桥而盘门、太湖之路又断。寇乃句结浙党,图扑吴江,以扰我后。学启率水陆军击破嘉、湖援寇,擒斩伪贵王陈得胜及悍党四十馀,追至平望,断其桥。从此攻苏之军无牵掣之患。
伪平东王何明亮等以刘典屯绩溪,不克上犯徽、歙,遂由宁国千秋关窜浙江,陷昌化,扰於潜。其前窜广德者,复折踞孝丰。刘典遣军出绩溪昱岭关援剿。江宁军自攻克江东桥、上方桥,而城东数隘未下。近城者曰中和桥,曰双桥,曰七桥瓮,稍远者曰方山、土山,曰上方门、高桥门,迤南则为秣陵,以至博望镇,皆金陵外辅也。国荃以东路未平,不能制寇死命,令诸军东渡。提督萧衍庆过河破五垒,城寇出争,击退之,遂克上方门、高桥门、双桥门。右路方山、土山之寇亦弃垒而奔。七桥瓮踞寇仓皇欲遁,而城中忽出大股来援,两军相搏,总兵萧孚泗乘夜纵火,寇冒火突出,遂克七桥瓮。其博望镇,总兵朱南桂已先五日袭取之。博望镇既失,则秣陵关之势孤;七桥瓮既失,则中和桥之势孤。总兵伍维寿等南略秣陵关,寇弃垒奔溃。自是锺山西南无一寇巢。
伪奉王古隆贤诣朱品隆降,收复石埭、太平、景德三城,徽州肃清。馀寇窜踞宁国、广德、孝丰之间,势甚涣散。宗棠饬刘典由昌化、於潜趋临安,进剿孝丰,为规取湖州之地。十月,易开俊克宁国县城。自是东坝黎立新上书请为内应,建平张胜禄上书请献城池。鲍超等遂合趋东坝,绕垒环攻。杨辅清从乱军中逸出,寇立献伪城。东坝既克,建平张胜禄等即於是日斩伪跟王蓝仁得,举城降,而溧水寇杨英清亦缴械降,遂收二城。国荃克淳化镇、解谿、龙都、湖墅、三岔镇等隘,毁寇垒二十馀。江宁城东南百里内寇巢略尽。
苏州军自黄埭攻浒墅关,破王瓜泾、观音庙寇垒,直抵浒墅,击走伪来王陆顺德,进毁十里亭。虎丘、枫桥寇皆遁。蹑至阊门,寇大恐。李鹤章败寇无锡鸭城桥,破西仓寇垒,直抵茅塘桥。李侍贤调常州陈坤书来援,城寇黄子澄出迎,我军纵击败之。秀成闻浒关已失,退屯北望亭,谋返苏州老巢。坤书还走常州,侍贤遁宜兴、溧阳,我军乘之,下寇垒百馀。鸿章督军攻娄门寇。苏州四年自我军连克要隘,乃於胥、葑、娄等门凭河筑垒数十,娄门外石垒尤坚。至是我军由南北岸而进,秀成等突出娄门拒战,程学启与常胜军分队以应,援寇遁入城。水师会攻娄葑门外寇垒二十馀皆下。我军连克齐盘门各垒,三面薄城,寇众恟惧,而秀成及谭绍光犹图固守,他酋郜云官等皆有贰心,密请於鸿章乞反正,许之。学启、戈登单舸见云官等,命斩秀成、绍光以献;而云官不忍杀秀成,许图绍光。秀成觉之,涕泗握绍光手为别,乘夜率万人自胥门出走嘉善。郜云官杀谭绍光,率伪比王伍贵文,伪康王汪安均,伪宁王周文佳,伪天将范起发、张大洲、汪朅武、汪有为,开齐化门迎降,鸿章受之。云官等未薙发,要总兵、副将等官,并请自领其众屯守盘、齐、胥、阊四门。程学启虑其不可制,密请於鸿章诛之,立复苏省。
秀成以轮船炸炮越无锡水师北窜。十一月,李鹤章克同城无锡、金匮,追擒黄子隆与子德懋并诛之。刘秉璋等攻浙西,平湖寇陈殿选献城乞降。连日乍浦贼熊建勋、海盐浦贼皆反正。十二月,秀成留苏州败党分布丹阳、句容间,自率数百骑潜入江宁太平门,苦劝秀全弃城同走。秀全侈然高座曰:“我奉天父、天兄命,令为天下万国独立真主,天兵众多,何惧之有?”秀成又曰:“粮道已绝,饥死可立待也!”秀全曰:“食天生甜露,自能救饥。”甜露,杂草也。秀成以秀全恋老巢不肯去,非口舌所能争,乃贻书溧阳约李侍贤,锐意走江西。