清军之复盛
清朝的兵力，当川楚教匪乱时，即已毫不足用。当时虽有许多官兵作战，实在所靠的还是乡勇。到太平天国起后，就更不成话了。向荣的兵，尾随着太平军之后，从广西直到江宁，丝毫不能阻止他的活动。当时清朝还有一支大兵，驻扎在江北，合向荣的兵，称为江南、江北两大营。可是太平军都视同无物。要是清朝的军队，都是如此，清朝早好推翻了。但是从湘淮军出，而形势一变。湘淮军亦都是乡勇。湘军为曾国藩所练，一出之后，就克复武汉，又攻陷九江。胡林翼坐镇武昌，发兵从水陆两路东下，以取安徽。此时太平天国中，又有一个后起之秀，把残局支持了好几年，是为忠王李秀成。李秀成使陈玉成救皖北，大败湘军于三河集。湘军水陆两路都撤退。又分兵窜扰江浙，以分江南大营的兵力。此时江北大营，也将江南大营兼统了。秀成度其势分力弱，一举把他攻破。苏、松、常、太相继而下。太平军的军势又一振。但是单靠一个李秀成，到底支持不了危局。清朝用曾国藩做两江总
曾国藩像
李鸿章像
常胜军
督。国藩分兵平定赣浙等省，并力以攻安庆，到底把安庆打破。湘军水陆沿江而下。又使李鸿章募兵于淮徐，以窥苏松。淮军亦勇悍善战。此时避居上海的清官，用洋将以练华兵，名为常胜军，器械既精利，训练亦良好，亦隶李鸿章麾下。于是苏松亦终于不守。
太平天国之灭亡
李秀成乃退入天京死守。公元1864年，天京失陷，天王先已服毒殉国。秀成奉幼主福瑱出走，于路上为清军所获，不屈，死之。福瑱亦殉国于南昌。余党在赣、闽、广东的，不久亦为清军所消灭。太平天国遂亡。
太平天国最盛时之疆域
太平天国，首尾凡15年。自其起事以来，曾四次攻破武昌，三次攻破汉阳，但终未能坚守，为清军所据，用为进攻的根据地。其和湘军支持最久的，则为九江。自九江陷后，上流就但恃安庆为天京的屏蔽了。但是他所蹂躏的地方，实在不少。通计本部十八省中，只有陕甘两省未到。而苏松和江西、浙江，尤为天国将亡时，据以与清军争持的要点。
太平军的余波，是为捻匪[4]。捻匪是很早就有的。太平军起后，其势亦盛，蔓延于安徽、山东、河南之间。太平天国亡后，余党都和捻匪相合，其势愈盛。清朝使僧格林沁去打他，败死。乃改用曾国藩。捻匪多马队，往来飘忽，势成流寇。国藩乃创圈制之法，于运河、贾鲁河沿岸筑长墙，想把他围困。然而到底被他突破，分为东西两股；东捻入山东，西捻入陕西。清朝以李鸿章代曾国藩，倒守运河，把东捻蹙到海隅平定。西捻由左宗棠剿办。捻众从陕北经山西回窜直隶，由李鸿章、左宗棠合兵打平。事在公元1867、1868两年。
同时西北、西南，又有回乱。西南回乱，起于公元1855年。回民杜文秀，占据大理。东部临安等处，也有叛回占据。清朝所派督抚，非不能到任，则为回酋所戕杀、所挟制。这时候，中原扰乱方甚，无力顾到西南。后由岑毓英抚用回将马如龙，次第把他打定。然合计前后，扰乱亦达18年之久。西北事变，则更为扩大。当太平天国将亡时，其扶王陈得才，曾由安徽北入河南。陕西募回勇设防。后来陈得才因回援天京不及，自杀。而陕西的回勇，因与汉民冲突，聚众互相仇杀，回乱就蔓延起来，旋又扩及关外。回酋妥得璘，占据乌鲁木齐，次第把天山南北路各城攻陷。先是乾隆时，布罗尼特死后，其子孙遁居浩罕。公元1820年，布罗尼特之孙张格尔，曾以浩罕兵攻入天山南路，为清人所杀。至此，浩罕人又借兵于其子布苏格，入据喀什噶尔。旋为其将阿古柏帕夏所篡，尽取妥得璘之地，想在中英俄之间，自建一独立国。英、俄、土耳其都和他往来，英国公使，且为之请求封册。捻匪平后，左宗棠进剿陕甘的回乱。至公元1873年，全行平定。时英人仍为阿古柏请求，朝议亦有以用兵烦费，主张将天山南路封他的。左宗棠力持不可。清朝乃即命宗棠进剿。时浩罕本国，已为俄所灭。天山南路的缠回，亦与阿古柏不合。阿古柏遂穷蹙自杀。公元1878年，天山南路亦全平。然伊犁为俄人所据，遂酿成中俄的交涉。
从太平天国起事之后，到新疆平定之时，其间约30年，几于全国糜烂，清朝居然能先后戡定，号称中兴，这也很堪惊异了。然而此时的清朝，虽名为中兴，实权都已入汉人之手。后来北洋军阀，所以推倒清廷，有如摧枯拉朽，其势力，还是从这时候递嬗而来的。而且民间的革命势力，也并未消灭。试看湘军裁而哥老会的势力即骤盛于长江流域可知。哥老会是以反清复明为宗旨的，湘军是帮助清朝灭掉太平天国的，然而哥老会的势力，竟能深入湘军军队之中，从兵士以至将弁都有会中人物，[5]可见会党势力的无孔不入了。三合会在粤江流域，势力也依然如故。而且随着华侨的足迹，蔓延及于海外，遂为后来革命的根源。