嘉靖十三年七月甲戌，上谕内阁：祖宗御像、实录、宝训，宜有尊崇之所。训、录宜加以坚楮书一編，作石匮藏之。内阁因议于南内建阁尊藏。其重写训、录，书帙大小，依《通鉴纲目》例规，不拘每月一册，异日收藏，每朝自为一柜，议定如篆修例，诏从之。因命武定侯郭勋为监录官，大学士李时，礼部尚书夏言，詹事顾鼎臣等为总视经理官。太常寺卿谢丕，侍读学士张璧，侍讲学士蔡昂等为副管录官。侍读张衮，侍讲江汝璧、杨维杰、唐顺之、欧阳衢，赞善张治，谕德姚涞，修撰王用宾，编修杨瀹、陈节之、胡经等为校录官，率誊录官生等同录。至嘉靖十五年八月乙酉书成。
以司礼监官一员提督之（《酌中志》一六）。以每年六月六日晒曝实录，《野获编》卷二四风俗：
六月六日本非令节，但内府皇史宬晒曝列圣实录、御制文集诸大函，则每岁故事也。
《酌中志》卷一七：
每年六月初六日奏知晒晾，司礼监第一员监官董其事而稽核之，看守则监工也。
世宗中年好道，日事斋醮，取宫中旧本安置于西城万寿宫，后被火灾。万历十六年神宗欲取读实录，阁臣因请另誊一小型本，以便观览。总明代实录正本贮皇史宬，自洪武至正德，均嘉靖重录本。副本藏内阁，宫中又别有洪武至隆庆小型本，书型较小，卷数亦有并省。详具本文传布篇。
五 掌故甲
（一）太祖
《太祖实录》凡三修，《明史》卷九七《艺文志》二记：
《明太祖实录》二五七卷，建文元年（1399）董伦等修。永乐元年（1403）解缙等重修。九年（1411）胡广等复修。起元至正辛卯（1351），讫洪武三十一年戊寅（1398），首尾四十八年。万历时，允科臣杨天民请，附建文帝元、二、三、四年事迹于后。
沈德符《野获编》卷一：
洪武三十一年（1398）八月，建文君新即位，征江西处士杨士奇充实录纂修官。至建文元年正月，始大开局修《太祖实录》。时总裁为礼部侍郎董伦、王景彰，副总裁为太常卿廖升、侍讲学士高逊志，纂修官为国子博士王绅、汉中府教授胡子昭、齐府副理审杨士奇、崇仁县训导罗恢、马龙他郎甸长官司吏目程本立。而监修者则未之闻。至洪武三十五年七月，实建文四年也，文皇帝新即位，以前任知府叶仲惠等修《太祖录》，指斥靖难君臣为逆党，论死籍没。本年十二月始命重修，其时监修者为曹国公李景隆、忠诚伯茹瑺，虽文武各一人，皆勋臣也。永乐九年，又以景隆、瑺等心术不正，编辑不精，改命姚广孝、夏原吉为监修，其纂修则属之胡广等，又命杨士奇、金幼孜佐之，而总裁则属祭酒胡俨，学士黄淮、杨荣。
此以初修本指斥靖难为叛逆，故命再修，又以再修之监修官李景隆、茹瑺心术不正，编辑不精，故命三修。二修时焚初修本，至三修时又毁二修本，前二本俱不可得见，《野获编》卷一又记：
本朝《太祖实录》修于建文中，王景等为总裁。后文皇帝靖难，再命曹国公李景隆监修，而总裁则解缙，尽焚旧草。其后永乐九年复以为未善，更命姚广孝监修，总裁则杨士奇，今所传本是也。然前两书所修，则不及见矣。
顾亭林亦指出二修、三修本之不同，要点在靖难一事，并揭出实录之特殊书法，《亭林文集》卷三《答汤荆岘书》：
《太祖实录》凡三修，一修于建文之时，则其书已焚，不存于世矣。再修于永乐之初，则昔时大梁宗正西亭曾有其书，而洪水滔天之后，遂不可问。今史宬及士大夫之家讳实录之名而改为《圣政记》者，皆三修之本也。然而再修、三修所不同者，大抵为靖难一事，如弃大宁而并建立之制，及一切边事书之甚略是也。至于颍、宋二公若果不以令终，则初修必已讳之矣。闻之先人曰：实录中附传于卒之下者正也，不系卒而别见者变也、当日史臣之微意也。今观卒后恩典之有无隆杀，则举一隅而三可反矣。
徐健庵则以为成祖为亲讳过举，故三修本极失实，其所上《修史条议》云：
《太祖实录》凡三修，一在建文之世，一在永乐之初，今所传者，永乐十五年重修者也。前二书不可得见，大要据实直书，中多过举，成祖为亲隐讳，故于重修时尽去之。其实太祖御制文集诰命，未尝讳也。今观此书疏漏舛误，不可枚举，当一一据他书驳正，不得执为定论。
夏燮最后出，其持论乃最精。燮以为再修、三修之用意，只在证明成祖确为高皇后所出，故懿文、秦、晋三兄死后，伦序当立。《明通鉴》卷首义例：