王莽辅政一年多，漠成帝去世，汉哀帝继位，尊称皇太后为太皇太后。王太后命令王莽辞官回家，让权给哀帝的外家。王莽遂呈上奏章请求辞官，哀帝就派尚书令韶命王莽说：“先帝把朝政托付给您而抛弃了臣属们，朕能够接掌江山，实在盼望跟您同心同德。现在您上书说有病要求辞官，从而显得朕不能顺从先帝的意旨，朕对此十分悲伤。已经命令尚书等待您入朝奏事。”又派遣丞相孔光、大司空何武、左将军师丹、卫尉傅喜禀告太后说：“皇帝听到太后的诏命，非常难过。大司马如果不出来做官，皇帝就不敢处理朝政。”王太后又命王莽任职理事。
这时哀帝的祖母定陶国傅太后、母亲了姬在世，高昌侯董宏上书说： “根据《春秋》之义，母以子贵而贵，丁姬应该加上尊号。”王莽和师丹共同弹劾揭发董宏迷误朝廷，违反原则，这些话记载在《师丹传》中。后来，未央宫举行宴会，内者令给傅太后设置了帷帐，坐在太皇太后的座位旁边。王莽巡视时见了就责备内者令说： “定陶国傅太后是藩王的太后、元帝的姬妾，怎么能跟最尊贵的人并列！”撤去帷帐，改设座位。傅太后听说这件事后，非常生气，不肯出席宴会，极其怨恨王莽。王莽又请求辞官，哀帝就赏赐王莽黄金五百斤，安车一辆和骏马四匹，免职回到府第。王公大臣和大夫们多有称赞他的，皇帝对他给予优待和爱护，在他家中安排专使侍候，让宫内太监每十天赏赐一次饮食。下韶书说：“新都侯王莽为国家忧虑操劳，一向按章行事，朕差不多能同他实现太平。太皇太后韶命王莽回到府第，朕对此十分惋惜。应当把黄邮聚的民户三百五十家加封给王莽，授予他特进加给事中的官衔，每逢初一、十五参加朝会，皇上接见他的礼仪如同接见三公那样，皇上出行时他乘坐绿车跟随。”
两年以后，傅太后、丁姬都有了尊贵的称号，丞相朱博上奏书说：“王莽从前不肯推广尊敬尊长的原则，压制降低太后的尊贵封号，有损孝道，应当明典正刑，幸亏遇到赦免的命令，不应当拥有爵位和土地。请予罢免，降为平民。”皇上说：“因为王莽与太皇太后有亲属关系，不免除爵位和封地，命令他回封国去”。
王莽闭门谢客，安分守己，他的次子王获杀死了奴婢，王莽严厉责备王获，要他自杀。留在封国三年，官吏上书替王莽伸冤的数以百计。元寿元年，出现了日食，贤良周护、宋崇等在回答皇帝的策问时极力颂扬王莽的功勋德行，皇上于是召回王莽。
当初王莽回到封国，南阳太守因为王莽地位高且重，选调太守衙门的属官宛县人孔休临时担任新都国相。孔休进见王莽，王莽用尽礼节主动结交，孔休也知道他的名声，和他互相来往。后来王莽病了，孔休问候他，王莽藉此报答孔休的深厚情谊，送上自己镶嵌有美玉的宝剑，打算和他建立友好关系。孔休不肯接受，王莽便说：“我确实是看到您脸上有伤痕，美玉可以用来消除伤痕，想送给您这个剑鼻罢了。”就取下剑鼻，孔休再次推辞。王莽说： “您是嫌它的价钱太高吗？”于是用椎打碎了剑鼻，自己包起来送给孔休，孔休才接受了。等到王莽被召入朝要离去时，想见孔休，孔休推托有病没有相见。
王莽回到京城长安一年多，哀帝去世，没有儿子，而傅太后和丁太后都在哀帝之前去世了，太皇太后当天驾临未央宫收取玺绶，派遣使者飞马去召唤王莽。命令尚书，朝廷所有派遣军队的符节凭证，文武百官向皇上陈述朝事，内宫太监和皇帝的亲兵都归王莽指挥。王莽禀告说：“大司马高安侯董贤年纪太轻，不符合大家的心意，收缴他的印信。”董贤当天就自杀了。王太后韶命王公大臣推荐适合接任大司马的人，大司徒孔光和大司空彭宣推荐王莽，前将军何武、后将军公孙禄互相推荐。王太后任命王莽为大司马，和他商议选立皇位继承人。安阳侯王舜是王莽的堂弟，他为人谨慎，是王太后所信赖的人，王莽提出让王舜担任车骑将军，叫他去迎接中山王来继承成帝，造就是孝平皇帝。平帝刚刚九岁，王太后临朝代理朝政，把政务委托给王莽。土莽提出以前趟氏害死了皇子，傅氏骄傲僭越，于是废掉孝成趟皇后、孝哀傅皇后，命令她们俩自杀，这些话记载在《外戚传》中。
王莽因为大司徒孔光是著名的儒士，辅佐过成帝、哀帝和平帝三位皇帝，是太后所尊敬的人，为全国人所信任，于是非常恭敬地对待孔光，推荐孔光的女婿甄邯担任侍中兼奉车都尉。对哀帝的各位外戚和平素不喜欢的身居要位的大臣，王莽都罗织他们的罪名，写成请示奏章，叫甄邯带给孑L光。孔光一向怕事和谨慎，不敢不上报。王莽又禀告王太后，太后就同意这些奏章。于是前将军何武、后将军公孙禄因互相推荐任大司马而被免职，丁氏、傅氏和董贤的亲属都被免去官职和爵位，流放到遥远的地方。
红阳侯王立是王太后的亲弟弟，虽然没有当官，但是王莽因为他是叔父而内心敬畏他，害怕王立得闲就开导太后，使自己不能为所欲为，就又叫孔光向太后禀报王立往日的罪遇：王立以前知道定陵侯淳于长犯了大逆不道之罪，还大量接受他的贿赂，替他说情，迷误朝廷；后来禀告用官奴杨寄的私生子作为皇子，大家说是吕后、少帝复活了，众说纷纭，让天下人怀疑，这样就难于昭示后世，完成维护幼主的功业。请让王立回他的封国去。”王太后没有听从他的建议。王莽说：“现在汉室衰落，接连几代没有继承人，太后您一个人代替幼主执掌朝政，实在可怕，努力用公正的态度作天下的表率，还恐怕不服从呢，如果您现在出于个人恩爱而不听我的意见，那么群臣就会滋生奸邪之念，祸乱将要由此发生了！应该暂时打发他回封国去，待国事稍为安定之后再把他调回来。”王太后迫不得已，让王立回封国去了。王莽用来逼迫、挟制太后和下臣们的手段，都是如此。
就这样，依附顺从他的人得到提拔，反对怨恨他的人遭到杀戮。王舜、王邑成为他的心腹，甄丰、甄邯掌管纠察、弹劾、审判，平晏掌管机密的军政大事，刘歆主管礼乐和典章制度，孙建成为他的得力助手。甄丰的儿子甄寻、刘歆的儿子刘菜和涿郡的崔发、南阳的陈崇都由于有才能而得到王莽的宠幸。王莽外表严厉而说话一本正经，想要做什么事情，他衹须略微通过表情和脸色示意一下，党羽就会秉承他的意思明白地向上禀奏，王莽就叩头至地哭泣着坚决推辞谦让，对上用来迷惑王太后，对下用来向广大平民百姓显示诚信。
当初，王莽婉言示意益州令让塞外的蛮夷进献白毛的雉鸡，元始元年正月，王莽禀告太后下诏书，用白毛雉鸡进献宗庙。大臣们便向太后奏报说： “太后委任大司马王莽决策拥立新帝，从而使朝廷安定。先前的大司马霍光有安邦定国的功劳，增加封邑三万户，并且规定他死后子孙继承爵位，封邑数同他相等，如同萧相国。王莽应当按照霍光的成例授封。”王太后询问王公大臣门说：“真是因为大司马有大功劳应当明扬他呢？还是由于他是我的至亲缘故而使他与众不同呢？”于是大臣们便大力陈奏：“王莽的功德招来了像周公辅佐周成王获得白雉鸡一样的祥瑞征兆，相隔千年，符命却相同。圣明的帝王的法度是，臣下有了大的功勋，那么他生前就能获得美好的称号，所以周公在世时就得以用周的国号作为他的称号。王莽有稳定国家、安定汉朝的莫大功勋，应当赐封称作安漠公，增加封户，规定他死后子孙继承爵位时封邑户和他一样，远的符合周公在周成王时的成例，近的如同霍光的先例，给王莽同等的封赏，以求顺上天的旨意。”王太后就诏令尚书备办这件事。